在制药的过程中，会产生出大量的废水，其中所含的有机物质多、化学成分复杂，从而增大了制药废水的处理难度。其废水来源如下：

　　1、工艺生产废水，如各类结晶母液、吸附残留液、转向母液等。

　　2、冲洗废水，如过滤机、反应器、催化剂载体、离子树脂等设备和材料的洗涤废水，以及地面、器具等地面洗刷废水等。

　　3、回收残留液，包括溶剂回收残留液、副产物回收残留液等。

　　4、辅助过程废水，如循环水、密封水、溢出水等。

　　5、厂区生活废水。

　　如果未经处理或是处理后未达到标准的制药废水排放到自然环境当中，则会造成严重的污染。因此，对制药废水进行有效的处理显得尤为必要。这就要求制药企业采用合理可行的废水处理工艺技术。目前国内外处理高浓度有机废水主要是以厌氧法为主，但经单独的厌氧方法处理后出水COD仍较高，一般需要进行后处理。

　　随着膜技术的不断发展，膜生物反应器(MBR)在制药废水处理中的应用研究也逐渐深入。MBR综合了膜分离技术和生物处理的特点，对废水水质、水量的变化具有较强的耐冲击能力。具有容积负荷高、抗冲击能力强、占地面积小、剩余污泥量少等优点。采用MBR膜技术，对COD的去除率均保持在90%以上，BOD5去除率达98%，COD去除率达95%，处理效果稳定，是处理制药废水的一种理想工艺选择。